Mint olyan sokszor korábban ezen a Tour de France-on, ismét egy szökevény ünnepelhetett a második pihenőnap után, a viadal 16. etapján, amely egy 169 kilométeres szakasz volt négy kategorizált emelkedővel. Az először kialakult, háromfős élboly nem volt eredményes, hiszen 105 kilométerrel a cél előtt bedarálták őket, ám egy népesebb csoport már sikerrel járt. Ebből maradt egyedül az utolsó komoly, hosszú meredeken az osztrák bajnok Patrick Konrad, aki 36 kilométert szólóban teljesítve, közel egyperces előnnyel diadalmaskodott. Az összetett élén nem történt változás.
Végeredmény, 16. szakasz (El Pas de la Casa–Saint-Gaudens, 169 km): Patrick Konrad 4:01:59 óra, Sonny Colbrelli +42 mp, Michael Matthews, Pierre-Luc Périchon, Franck Bonnamour a. i. stb. Az összetett állása: Tadej Pogačar 66:23:06 óra, Rigoberto Urán +5:18, Jonas Vingegaard +5:32, Richard Carapaz +5:33, Ben O’Connor +5:58 perc stb.
